En del av bristerna som funnits tidigare är åtgärdade, men vissa kvarstår trots att de uppdagats förut. Framför allt gäller detta Jordbruksverkets hantering, enligt Ekonomistyrningsverket.
Inom två av programmen, som hanteras av Jordbruksverket och Polismyndigheten, fanns en felprocent i utbetalningarna på över 2 procent, vilket är EU-kommissionens gräns för när hanteringen inte bedöms som tillfredsställande.