Han behövde bara tolv minuter på sig för att bli målskytt, hans tredje fullträff i Serie A-fotbollen den här säsongen.
Svensken tryckte dit sin egna straffretur efter att Samir Handanović gjort en jätteräddning i förstaläget.
Zlatan fixade själv straffen efter att Aleksandar Kolarov fällt svensken i en spelvändning.
Fyra minuter senare kom 2–0 av Ibrahimoic efter att Rafael Leão spelat fram honom. Inter reducerade efter en halvtimmes spel genom Romelu Lukaku.
Under sin coronafrånvaro missade Zlatan Ibrahimovic fyra matcher, Europa League-matchen mot Bodø/Glimt inkluderad, sedan han konstaterades smittad 24 september.
Matchen pågår.