Detta sedan en elva månader gammal flicka på söndagen dukat under för sjukdomen.
Innan helgen hade det gått drygt sju veckor sedan det närmast föregående ebolafallet, och hade det inte varit för de två nya dödsfallen så hade utbrottet formellt förklarats vara över på söndagen.
"Tyvärr innebär detta att regeringen inte kommer att kunna förklara att utbrottet är över, som man hoppats", skriver WHO-chefen Tedros Adhanom Ghebreyesus på Twitter.
Fler än 2 200 människor har mist livet sedan ebolautbrottet – det tionde i Kongo-Kinshasas historia – startade i augusti 2018.