Tågstoppet ska bero på ett elfel som uppstått på grund av ovädret.
Det blev även stopp för Mälartåg på sträckorna Eskilstuna-Linköping och Västerås-Sala.
Erik Söderberg, presschef på MTR, vill inte spekulera i när tågen ska gå igen.
– Vi har just nu stopp på flera linjer vad gäller Mälartåg. Det beror på blåsten. Det är skadade kontaktledningar som orsakar problemen. Det här har skett relativt nyligen, så vi har ingen prognos för när det är löst. Vi arbetar för att lösas så snabbt som möjligt, säger han vid 16.15-tiden.
Hur lång tid brukar sådana här problem ta att lösa?
– Jag vill inte spekulera i det så här tidigt inpå. Vi kommer att undersöka och reparera.
Kan tågpendlare hoppas på att komma hem med tåget senare under kvällen?
– Jag vill som sagt inte spekulera.
På stationen i Nyköping rådde kaos efter 16-tiden, med många pendlare som är strandsatta i Nyköping.
Matilda Anttila är en av dem. Hon var på väg till Norrköping, men blir kvar här.
– Tåget gick nästan till Kolmården, och vände och åkte tillbaka. Nu är jag strandsatt här. Jag har väntat i 40 minuter. Men jag skulle varit hemma i Norrköping för en timme sedan. Vi har ingen aning om hur länge vi blir kvar här. Det är väl bara att vänta.
Therése Murén ska också till Norrköping.
– Det är ganska tråkigt, säger hon.