När räddningstjänsten var på plats klockan 12.50 ska personalen själva ha lyckats släcka branden.
– Det brann i två papperskorgar på toaletter i A-huset, säger Magnus Andersson, operativ chef vid Södertörns brandförsvar.
Räddningstjänsten hjälpte till med ventilering av lokalerna och stannade därefter kvar och pratade med personalen på skolan.
Såväl Nyköpings gymnasium som Nyköpings högstadium har under tidigare läsår haft flera incidenter med anlagda bränder i papperskorgar. Åtminstone några av dem har klarats upp.
Det finns i nuläger inga uppgifter om vad som orsakat måndagens brand på Gripenskolan.