Skolan uppmärksammade att elever misstänks ha sexuellt trakasserat och ofredat andra elever på samma skola. Det handlar om flera olika incidenter som skett på och utanför skoltid, enligt Nyköpings kommun.
Utbildningschef Anci Stierna säger att man har nolltolerans vad gäller de aktuella misstankarna.
Polisanmälningarna har gjorts.
Ola Björstrand bekräftar att en anmälan tagits emot och att utredning pågår, men vill inte i övrigt kommentera utredningen.
Med tanke på de misstänktas ringa ålder kan, enligt lagen, en utredning bara inledas "om det finns synnerliga skäl".
– Vi kommer att skyndsamt arbeta med utredningen, men allt beror på omfattningen, säger han.
Eleverna stängdes av helt från att besöka och vara i skolan i fyra dagar. Eleverna fullgör sin skolplikt hemma och får studiematerial tillsänt till bostaden.
Skolan har haft kopplat in socialtjänst, polis och kommunens egen enhet räddning och säkerhet. Möten har hållits för att ta fram lösningar på både kort och lång sikt samt hur man ska hantera situationen.
Samtal med berörda vårdnadshavare har också genomförts. Information till samtliga målsmän har skickats ut av rektorn på skolan.
Att elever av olika skäl stängs av från skolor förekommer. Det kan handla om misstanke om drogpåverkan eller misshandel. Men då rör det sig sällan om elever i skolor upp till tolv, tretton års ålder.
Möjligheten till avstängning av elever är förhållandevis ny i skollagen. I vissa fall får rektorn fatta beslut om att stänga av en elev helt eller delvis. Det kan ske för att man på skolan ska klara av en akut situation.
En avstängning genomförs av rektor och ska uppfylla några krav, bland annat: att det är nödvändigt med hänsyns till andra elevers trygghet och studiero eller av särskild hänsyn till elevens beteende.