Våldtäkten ska ha ägt rum i Trosa i slutet av januari. Händelsen kom till polisens kännedom via en målsägande, som nyligen gjorde en polisanmälan.
Åklagare Mika Segerdahl vill i dagsläget inte berätta något mer om varken händelsen eller den målsägande personen.
– Det är av hänsyn till målsägandes personliga integritet och av hänsyn till den pågående utredningen, säger hon.
Den misstänkta mannen häktades på fredagseftermiddagen av Nyköpings tingsrätt. Utredningen kommer nu att fortsätta med bland annat förhör.
Åklagare Mika Segerdahl räknar med att kunna väcka åtal inom två veckor.
– Det är min prognos just nu. Utredningsläget ser bra ut, säger hon.