Regeringen meddelade på onsdagen att nedstängningen gäller från och med lördag 7 november.
– Denna andra nedstängning är inget att vara lycklig över, säger premiärminister Saulius Skvernelis.
Litauen införde lockdown i två månader i våras.
Sällskap som består av fler än fem personer förbjuds, gymnasieskolor och universitet stängs och restauranger får inte ta emot gäster. Invånare ombeds också att undvika icke nödvändiga resor.