Lagets halvtidsledning utökades i andra halvlek till seger 3-0 (2-0) borta på Östertälje IP.
Kerim Sehovic, Amir Strukan och Johan Urborn blev målskyttar för IFK Nyköping i bortasegern.
Afrikansk FC har fem förluster på de senaste fem matcherna, medan IFK Nyköping har två vinster, två oavgjorda och en förlust.
Det här betyder att Afrikansk FC ligger kvar på tolfte och sista plats i tabellen, och IFK Nyköping på tredje plats.
I nästa match möter Afrikansk FC Jäder borta och IFK Nyköping möter Triangeln hemma. Båda matcherna spelas lördag 10 september 14.00.