"Lewandowski har en sträckning i vänstra baksidan av låret", skriver Barcelona i ett uttalande, utan att uppge hur lång tid 34-åringen beräknas bli borta.
Han skadades sannolikt i söndagens spanska ligamatch mot Almeria (0–1). På torsdag spelas den första semifinalen i Copa del Rey, på Santiago Bernabéu, och Barcelona har redan Pedri och Ousmane Dembélé på skadelistan. Returen spelas inte förrän den 5 april.
Lewandowski är lagets skyttekung med 25 mål under säsongen, hans första efter att ha lämnat Bayern München förra sommaren.