Segermålet för Nyköping BIS stod Albin Eklund Söderström för efter 88 minuter.
Målskyttarna bakom segern var Viktor Andersson, Albin Eklund Söderström, Martin Padron och Maximiliam Rehnqvist Bovbjerg. Jikenj Lam Gai, Jonathan Lämsä och Jahn Poul Ilo gjorde målen för Athletic Eskilstuna.
Athletic Eskilstuna har en vinst och fyra förluster på de senaste fem matcherna, medan Nyköping BIS har två vinster och tre förluster.
Det här betyder att Athletic Eskilstuna ligger kvar på tolfte plats i tabellen, och Nyköping BIS på nionde plats.
I nästa match möter Nyköping BIS Karlstad Fotboll hemma på lördag 3 september 13.00.