Bortalaget Flen hade ledningen i halvtid, med 2-1, men efter pausen vände Trosa Balkan matchen och vann till slut med 3-2.
Flens mål gjordes av Gustaf Falk och Azizbek Karlsson.
Det här var Trosa Balkans fjärde uddamålsseger den här säsongen. Förlusten var också Flens tredje uddamålsförlust.
Söndag 1 oktober 17.30 spelar Trosa Balkan borta mot Södertälje FF. Flen möter Järna hemma på Hammarvallen lördag 30 september 15.00.