21-åringen skadade knäet på en träning i österrikiska Reiteralm inför veckans världscuptävlingar. På onsdagen konstaterades att hon drabbats av en korsbandsskada.
"Säsongen är dessvärre över och operation planeras nu för Linnea", säger skicrosslandslagets läkare Jakob Swanberg i ett pressmeddelande.
Därmed blir det stora guldhoppet Sandra Näslund ensam kvinna i Sveriges VM-trupp. På herrsidan är dock familjen Mobärg representerad genom bröderna David och Erik Mobärg. De två sista namnen i laget är Elliott Baralo och Fredrik Nilsson.
Skicross-VM i Georgien avgörs 23–25 februari.